GCanner: un scanner molecular para analizar el genoma del parásito causante de la enfermedad Chagas

Un equipo de científicos del CONICET y la Universidad Nacional de San Martín (UNSAM), en Argentina, ha desarrollado GCanner, una innovadora herramienta informática diseñada para analizar de forma rápida y automática el genoma del Trypanosoma cruzi, parásito responsable de la enfermedad de Chagas.

Hasta ahora, cada laboratorio ha venido utilizando sus propias reglas para interpretar los datos, lo que genera errores y resultados difíciles de comparar. Esta nueva plataforma funciona como un escáner molecular que unifica los criterios de análisis, evitando así los sesgos humanos, e invita a que científicos de cualquier país estudien al parásito bajo las mismas condiciones exactas.

GCanner innova en su capacidad para dividir el complejo mapa genético del parásito en dos grandes zonas según su composición química elemental, sin necesidad de interpretar manualmente cada función. Por un lado, localiza las regiones estables o «centrales» (llamadas core), que contienen los genes esenciales para que el organismo sobreviva y que comparte con otros patógenos emparentados, como el de la leishmaniasis. Por otro lado, detecta las regiones «disruptivas», zonas altamente inestables y cambiantes donde se esconden los llamados factores de virulencia. Estos últimos son los genes que el parásito utiliza estratégicamente para invadir las células humanas y camuflarse, esquivando las defensas de nuestro sistema inmunitario.

Para probar la eficacia de este sistema, el equipo utilizó como modelo de referencia la cepa «RA», una variante autóctona de Argentina que es especialmente agresiva y se usa en los laboratorios para recrear los casos más graves de la enfermedad. En una investigación previa, científicos del Instituto Pasteur de Montevideo lograron secuenciar por primera vez el genoma completo de esta cepa local con precisión. Descubrieron que el parásito posee un arsenal compuesto por unos 17.000 genes comunes y cerca de 7.000 genes exclusivos dedicados puramente a atacar al ser humano. Al aplicar el software GCanner sobre este mapa genético de alta resolución, los investigadores lograron ubicar con coordenadas exactas dónde se esconde cada uno de esos 7.000 genes ofensivos. Esta investigación se detalla en la publicación científica Methods in Molecular Biology.

La estandarización que ofrece GCanner podría abrir una nueva era en la lucha contra la enfermedad de Chagas, pues al conocer a fondo la estructura biológica de las cepas, se facilita el camino para diseñar test de diagnóstico mucho más precisos y tratamientos médicos avanzados hechos a la medida de cada variante del parásito.